Small RNA测序主要是收集样本中18~30nt的RNA片段,主要包括miRNA、piRNA和siRNA,它们主要功能是诱导基因沉默、基因转录后的调控,从而调整细胞生长、分化及个体发育、生殖等重要生物学过程。该技术可检测Small RNA单个碱基的差异,既能鉴定已知的Small RNA,又能发现新的Small RNA。